Flora Catalana compta amb una Junta Directiva i amb l’Assemblea General que defineixen l’estratègia a seguir per l’associació alhora que s’encarrega de dirigir-la. Per dur a terme aquesta estratègia l’associació s’estructura en dos nivells: els Grups de Treball i els Grups Locals.
Els Grups de Treball són grups de socis de Flora Catalana que s’ajunten i coordinen per dur a terme un projecte o tasca concreta, que contribueix a l’estratègia definida per la Junta. La direcció dels grups de treball sempre es compon de dues persones: el vocal de Junta, que ocupa la vocalia que es responsabilitza del grup de treball, i un coordinador, que s’encarrega de coordinar la labor dels socis voluntaris que formen el grup de treball. La participació en el grup com a membre és voluntària però requereix l’aprovació prèvia per part de la Junta Directiva.
Els Grups Locals són grups de socis, distribuïts pel territori de Catalunya. Els grups locals són autònoms i es coordinen amb la Junta Directiva per tal d’aconseguir unitat d’acció. Aquests grups organitzen sortides, exposicions i d’altres activitats amb la finalitat de divulgar el coneixement en botànica i etnobotànica.
Junta Directiva de Flora Catalana
Grup de Treball de Comunicació
Vocalia d'Etnobotànica
Vocalia de Botànica
Vocalia d'Història
Vocalia d'Informàtica
Flora Catalana al territori